높은 처리량 시퀀싱 데이터를위한 품질 관리 분석 도구
- 소프트웨어 : FastQC
- OS : Linux,Mac,Windows
- 프로그래밍 언어 : Java
- 공식 웹사이트 : HOME
FastQC 상세
FASTQC는 고효율 시퀀싱 데이터 세트에서 잠재적 인 문제를 발견하도록 설계된 품질 관리 분석 도구입니다.그 목표는 고효율 시퀀싱 파이프 라인에서 오는 원시 서열 데이터의 품질을 확인하는 간단한 방법을 제공하는 것입니다.FASTQ 또는 BAM 형식의 하나 이상의 RAW 시퀀스 파일에서 모듈 식 분석 세트를 실행 하여이 작업을 수행합니다.그런 다음 결과를 요약 한 보고서를 생성하고 라이브러리가 특이한 것처럼 보일 수있는 영역을 강조 표시합니다.그런 다음 데이터가 문제가있을 수있는 곳으로 보내어 추가 분석을하기 전에 필요한 단계를 수행 할 수있는 단계를 수행해야합니다.
FASTQC는 특정 유형의 특정 유형의 시퀀싱 기술에 연결되어 있지 않으므로 볼 수 있습니다.다양한 실험 유형의 도서관에서 (게놈 시퀀싱, 칩 -SEQ, RNA-SEQ, BS-SEQ 등) 등).